Введение. Молекулярная генетика и ее ДНК-технологии позволяют определять вариации генов, ответственных за хозяйственно-ценные качества молочного поголовья. Идентификация генетического разнообразия даст возможность молочному животноводству особый вариант подхода в нелегком труде животноводов. Превосходство молекулярного подхода заключается в том, что он позволяет идентифицировать ДНК-профиль особи еще в раннем возрасте, и это очень облегчит работу селекционеров. В соответствии с этим, для увеличения эффективноcти ведения племенной работы нами была поставлена цель – провести ДНК-анализ полиморфных вариантов генов белкового обмена у животных, таких как: (CSN3) каппа-казеин, бета-лактоглобулин (BLG) и пролактин (PRL), а также выявить взаимосвязь их полиморфных вариантов с признаками молочной продуктивности. Для решения поставленной цели были отобраны пробы ДНК от группы из 69 голов коров. В результате проведенных исследований были идентифицированы рекордсмены среди исследуемого поголовья животных (генотипы CSN3BB, BLGAB, PRLAA), которые отличались значительным превосходством по основным показателям ценности молока среди исследованных дойных коров (белок и жир). При комплексном исследовании генотипов генов CSN3, BLG и PRL с молочной продуктивностью коров было выявлено 15 различных комплексных генотипов, и наиболее распространенным из них сочетания генотипов: PRLAACSN3AABLGAA, PRLAACSN3AABLGAB, PRLAACSN3AABLGBB, и PRLABCSN3AABLGBB. Исследованиями показано, что коровы с комплексным генотипом PRLAACSN3BBBLGAB имеют самые высокие удои молока (7424,5 кг), молочного белка (4,1 %), жира (349 кг) и протеина (304,9 кг). Принято решение о включении вновь выявленных животных-носителей желаемых сложных комплексных генотипов в племенное ядро для дальнейшего получения высокопродуктивного потомства, что позволит повысить эффективность молочного скотоводства и уровень рентабельности производства молока.